Lewandowski sempat mencetak gol lagi pada menit ke-38, namun dianulir wasit setelah meninjau VAR.
Gol tersebut dianulir karena pada prosesnya, Pavard berdiri di posisi offside terlebih dahulu.
Gol kedua lahir pada menir ke-45+2 dari kaki Thomas Mueller yang memanfaatkan umpan matang Leon Goretzka.
Baca juga: Bayern Muenchen Resmi Pinjam Alvaro Odriozola dari Real Madrid
Sementara itu, Schalke yang tampil di bawah tekanan hanya mampu menghasilkan satu tembakan tepat sasaran dari empat percobaan.
Kedudukan 2-0 untuk Bayern bertahan hingga turun minum.
Memasuki babak kedua, Bayern langsung mendapat dua peluang sekaigus pada menit ke-49, lewat tendangan bebas David Alaba dan sepakan voli Thiago Alcantara.
Namun, dua peluang tersebut mampu dihentikan kiper Schalke, Markus Schubert.
Setelah dua peluang emas itu, Bayern akhirnya benar-benar mencetak gol semenit berselang lewat sepakan akrobatik Leon Goretzka.
Tak puas dengan tiga gol, Bayern menambah keunggulan menjadi 4-0 pada menit ke-58.
Umpan mendatar Lewandowski di kotak penalti Schalke berhasil dikonversi menjadi gol oleh Thiago Alcantara.
Memasuki menit ke-75, Bayern masih mendominasi dengan 75 persen ball possession, sementara Schalke hanya 25 persen.
Baca juga: Serge Gnabry Perpanjang Daftar Cedera Bayern Muenchen di Awal Tahun
Bayern juga menambah shot on target mereka menjadi 12 dari 19 percobaan.
Terus menyerang Bayern, menambah keunggulan menjadi 5-0 lewat gol yang dicetak pemain pengganti, Serge Gnabry.
Gol tersebut menjadi yang terakhir dalam pertandingan ini.
Laga Bayern Muenchen vs Schalke berakhir dengan skor 5-0.
Baca juga: Liga Jerman, Persaingan Timo Werner dan Lewandowski Berlanjut untuk Jadi Top Skor