Perwakilan dari setiap klub turut hadir dalam pengundian. Masing-masing dari mereka mengambil kertas undian yang menentukan grup.
Akhirnya, Persija Jakarta yang sempat masuk Grup E, bertukar tempat dengan Pusamania Borneo FC.
Babak 8 besar berlangsung dari 12 Desember hingga 20 Desember 2015. Solo dipilih sebagai tempat berlangsungnya Grup D, sedangkan Sleman untuk Grup E.
Mahaka Sports and Entertainment tak akan melakukan pengundian pada babak semifinal. Nantinya, juara Grup D bertemu dengan runner-up Grup E, sedangkan juara Grup E bersua dengan runner-up Grup D.
Berikut hasil undian 8 besar Piala Jenderal Sudirman:
Grup D
PS TNI
Mitra Kukar
Persija Jakarta
Semen Padang
Grup E
Arema Cronus
Pusamania Borneo FC
Surabaya United
Persipura Jayapura